Les effets secondaires de la chimiothérapie seront variables selon le protocole retenu. La plupart des chimiothérapies peuvent faire baisser les globules blancs (risque d'infection) et les plaquettes (risque hémorragique).
Des effets secondaires digestifs (nausées, vomissements) sont fréquents mais d'intensité variable et ils peuvent être atténués par des traitements protecteurs.
Les effets secondaires sur le rein, le cœur, la peau et les cheveux ne sont pas systématiques, mais peuvent dans certaines situations, se révéler fréquents. Ils dépendent surtout du type de produit utilisé et des doses administrées. Ces questions feront l'objet d'une information préalable du patient et si possible de traitements préventifs associés à la chimiothérapie.